上海市中医医院血液病科创建于2003年4月，现为上海中医药学会血液病分会主任委员挂靠单位，上海瑞金血液医疗联合体成员单位。拥有一批技术精湛的医护团队，现有医生10名，护士12名。其中，高级职称4名、中级职称医师4名、住院医师2名，博士生导师1名，硕士生导师2名。名中医师承培养2名。科室设有病床25张，以血液免疫性疾病诊疗为特色，年均门诊量达14237人次，每年收治各类血液病患者1500余例。
2016年起，血液科作为全国59家成员单位组成的瑞金血液专科医联体单位之一，开展了大量中西医协同重大疑难病种的攻关工作，双方以“亚专科+医联体”模式，共同能力，与瑞金医院协同申报获批立项重大课题3项，成为上海市中西医结合的组建血液免疫病亚专科，立足解决疑难危重患者的诊治，在市中医医院建立亚专科病房，主要收治重型免疫性血小板减少症、再生障碍性贫血和骨髓增生异常综合征，双方通过成立疑难病例中西医联合会诊专家小组和联络小组，形成了积极、流畅的中西联合诊治运行机制和联络机制，极大提升了专科专病的临床服务行业标杆。
科室坚持以中医药为主，中西医结合为主治疗各种血液病。学科重点发展方向包括再生障碍性贫血、免疫学血小板减少症、骨髓增生异常综合征、淋巴及浆细胞肿瘤等。临床擅用多种经验方，如健脾补肾解毒方治疗骨髓增生异常综合征、补肾方治疗再生障碍性贫血、三七升板汤治疗免疫性血小板减少症、解毒消瘤方治疗淋巴瘤、清肝化瘀汤治疗慢性白血病等；并开展了包括艾灸、蜡疗、中医定向透药、中药涂擦、穴位注射、穴位贴敷、足部熏洗等多种非药物特色治疗，利用经络渗透原理达到促进造血、调节免疫、抑制肿瘤、改善患者放化疗后周围神经病变等并发症。
近5年血液病科先后获得各级课题20项，其中包括国自然2项、国家中医药管理局课题2项、上海市科委基金项目2项，发表核心期刊文章20篇，SCI7篇，牵头或主要参与全国指南或专家共识4项，关于MDS“虚毒并治”的理论研究荣获2020年度上海市科学进步二等奖、上海市中医药科技进步一等奖。
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